HPV Ömür boyu vücutta kalır mı? Bu sorunun cevabı açık değildir. HPV'ye hassas testlerde örneğin polymerase chain reaction (PCR) ve Hybrid Capture 2, pozitif olan kişilerin %70'i ilk yıl içinde, %90'ı ise 2 yıl içinde negatif oldukları görülmüştür. Bu durum HPV'ye karşı etkin immün cevaba yni kişisel bağışıklığa bağlıdır.HPV'ye karşı etkili immün cevabı olan çoğu kişide genital kondilom ve lezyon gelişmediğinden HPV'nin tamamen yok edilmesi veya baskılanması önemli değildir. Yaşamın geri kalan döneminde bağışıklık sisteminde ciddi zayıflama olduğunda, bazı kişilerde siğiller ve diğer HPV lezyonları nüks edebilir ve tekrar tedavi gerektirebilri